Em histologia é preciso utilizar corantes para analisar estruturas celulares e características de tecidos. Nesse contexto, podemos citar a acidofilia e a basofilia, que demonstram a afinidade de substâncias ácidas e básicas.
Assim, quando os corantes são ácidos eles dão pigmentação a substâncias de características básicas; e quando os corantes são básicos eles dão cor às moléculas ácidas.
A regra para quase todas as células é a seguinte: núcleos apresentam basofilia, e citoplasmas acidofilia.
Os conceitos de basofilia e acidofilia também podem ser aplicados às estruturas extracelulares como fibras do tecido conjuntivo, substância intercelular, matriz óssea e cartilaginosa. Os tecidos e órgãos que reagem com um corante básico são chamados basófilos e as estruturas que reagem com um corante ácido são chamadas acidófilas.

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